NYSE được điều hành bởi tập đoàn NYSE, gần đây mới sáp nhập thêm sàn giao dịch điện tử Archipelago Holdings. Sàn giao dịch của NYSE đặt tại 11 Wall Street, gồm có 5 phòng giao dịch, hỗ trợ tối đa cho việc tiến hành các giao dịch. NYSE đang sắp sửa sáp nhập thêm Euronext - sàn giao dịch chứng khoán lớn thứ 2 châu Âu để trở thành sàn giao dịch chứng khoán toàn cầu đầu tiên trên thế giới, sau khi NASDAQ có ý định sáp nhập với London Stock Exchange.
Các vụ giao dịch trên NYSE được thực hiện theo phương thức đấu giá liên tục. Mỗi loại cổ phiếu có một địa điểm giao dịch nhất định trên sàn. Những thành viên của sàn nào muốn mua bán một loại cổ phiếu nào đó cho nhà đầu tư sẽ tập trung quanh địa điểm của một người môi giới, đại diện cho một công ty niêm yết trên NYSE. Người môi giới này đóng vai trò như một nhà đấu giá trong một cuộc đấu giá mở (open outcry auction) để liên kết người mua với người bán. Để kích thích giao dịch những người môi giới này tung ra nhiều thông tin cho những người môi giới khác, và thi thoảng họ còn sẵn sàng cam kết bằng số vốn riêng của mình. Phương thức đấu giá mở này đem lại hiệu quả cao nhất, đồng thời giúp các nhà đầu tư có được mức giá công bằng nhất. Chính đặc điểm xuất hiện sự tương tác trực tiếp giữa các nhà môi giới và sử dụng nhận định của các chuyên gia trong việc đặt lệnh đã làm cho NYSE khác hẳn với các sàn giao dịch chứng khoán điện tử khác. Gần đây đã có ý kiến cho rằng nên đưa ra một cấu trúc giao dịch lai giữa cấu trúc đấu giá mở với sàn giao dịch điện tử.
Chỉ số chứng khoán tổng hợp NYSE (NYA) - NYSE Composite được xây dựng vào thập niên 1960 với giá trị cơ bản là 50 điểm, tương đương với chỉ số đóng cửa năm 1965, phản ánh giá trị của tất cả các cổ phiếu giao dịch trên sàn, thay vì chỉ có 30 cổ phiếu trong chỉ số công nghiệp Dow Jones. Trong lịch sử của NYSE, mức cao kỉ lục của chỉ số tổng hợp NYSE từng đạt 9,345.25 điểm vào 7/2/2007, mức thấp kỉ lục là 347.77 điểm vào 10/1974.
Giờ giao dịch của NYSE là từ 9:30 đến 16:00. Chỉ những người môi giới nào có "chỗ" (seat) trong NYSE mới được phép giao dịch trực tiếp các loại cổ phiếu trên sàn. Hiện NYSE có 1366 "chỗ" như vậy, và con số này vẫn chưa hề thay đổi kể từ năm 1953. Chỗ đứng trong NYSE hay gọi chính xác hơn là tư cách thành viên, là một hàng hoá được nhiều công ty tài chính săn lùng, vì nó cho phép họ trực tiếp giao dịch trên NYSE. Giá của một chỗ đứng như vậy thay đổi tuỳ thuộc vào từng giai đoạn phát triển kinh tế, giảm đi khi có suy thoái và tăng lên khi kinh tế tăng trưởng mạnh. Chỗ đứng được bán theo thời hạn 1 năm, với giá cao nhất từng đạt được là $625,000 vào năm 1929, tương đương với khoảng hơn 6 triệu USD theo hiện giá, giá này vào năm 2005 là 3.25 triệu.